本题考查企业所得税应纳税额的计算。

企业的应纳税所得额乘以适用税率，减去依照《企业所得税法》和国务院关于税收优惠规定减免和抵免的应纳税额后的余额，为应纳税额。其计算公式为：应纳税额=应纳税所得额×适用税率-减免税额-抵免税额。

依据题干数据，2025年度该公司应纳税额=（200-20）×25%=45（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查企业所得税的纳税人。

企业所得税的纳税人，不包括依照中国法律、行政法规成立的个人独资企业、合伙企业。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查企业所得税税收优惠。

企业从事下列农、林、牧、渔业项目的所得，减半征收企业所得税：

①花卉、茶以及其他饮料作物和香料作物的种植；【选项E】

②海水养殖、内陆养殖。【选项A】

【选项B、C、D错误】远洋捕捞；蔬菜、谷物的种植；农作物新品种的选育的所得免征企业所得税。

因此，本题正确答案为选项AE。

本题考查企业所得税的计税依据。

企业所得税的应纳税所得额是企业每一纳税年度的收入总额，减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额，其计算公式为：应纳税所得额=收入总额-不征税收入-免税收入-各项扣除-允许弥补的以前年度亏损。

因此，本题正确答案为选项D。