本题考查我国分税制管理体制的主要内容。

根据现行中央政府与地方政府事权的划分，中央财政主要承担国家安全、外交和国家机关运转所需经费，调整国民经济结构、协调地区发展、实施宏观调控所必需的支出以及由中央直接管理的社会事业发展支出等。

【选项A错误】医疗保险由于信息复杂程度高，除个人一般信息外，还需要医院、药品、不同疾病等复杂信息，所以，从国际经验来看，大国一般由中央与地方共管。在我国，应该以地方管理为主，中央提供帮助。

【选项B错误】对于义务教育支出来讲，由于中小学教育信息极度复杂，根据信息复杂性原则，应该由地方政府管理。

【选项C正确】跨境重点项目，主要包括跨境高速公路、国道和铁路建设，这些项目一般具有较强的外部性，因此建设的主要资金来源应由中央承担。

【选项D正确】界河管理支出是典型的全国性公共物品，并涉及国家主权利益，应该由中央统一协调和监督及承担相应的支出责任。

【选项E错误】失业保险可由地方自行管理。

因此，本题正确答案为选项CD。