选项B，个人转让自用达5年以上，并且是唯一的家庭生活用房取得的所得，免征个人所得税；选项C，房屋产权所有人将房屋产权无偿赠与配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹，对当事人双方不征收个人所得税。选项D，个人转让境内上市公司流通股票，免征个人所得税。

（1）自2023年1月1日至2027年12月31日，依据“六税两费”优惠政策相关规定，个体工商户减半征收耕地占用税。

（2）占用基本农田，加按150%征收耕地占用税。

（3）该个体工商户实际应缴纳耕地占用税＝2×20×150%×50%＝30（万元）。

应税营业账簿，以账簿记载的“实收资本”与“资本公积”两项合计金额为计税依据。资本公积转增股本，是资本公积和股本一增一减变动，不影响总额，所以不缴纳印花税。发放股票股利会导致企业留存收益减少，股本增加，所以要计算缴纳印花税。选项A不当选，选项B当选。采取委托贷款方式书立的借款合同纳税人，为受托方和借款人，不包括委托人。个人书立的动产买卖合同不属于应税凭证，不征收印花税，选项E不当选。

直接从事研发活动人员的工资薪金等加计扣除；用于研发活动的仪器折旧可以加计扣除，但是研发大楼不属于研发用仪器设备。选项E，不属于研发活动相关直接费用。选项A、B、E不当选。