耕地占用税、车辆购置税应计入有关资产成本，随存货销售结转扣除，或在以后各期采用折旧、摊销方式分期扣除，选项A、D不当选。企业所得税不得在税前扣除，选项C不当选。

留购的租赁货物，以海关审定的留购价格为关税计税价格，选项A不当选。运往境外修理的货物，出境时已向海关报明，并在海关规定期限内复运进境的，以境外修理费和料件费为基础审定计税价格，选项C不当选。易货贸易、寄售、捐赠、赠送等不存在成交价格的进口货物，由海关与纳税人进行价格磋商后，按照“进口货物海关估价方法”估定计税价格，5种估价方法应当依次使用，不能直接使用倒扣价格估价方法，选项D不当选。

水利工程占用耕地，减按每平方米2元的税额征收耕地占用税，选项A当选。军用码头占用耕地，免征耕地占用税，选项B不当选。农田水利设施占用耕地，不缴纳耕地占用税，选项C不当选。城区内机动车道占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税，选项D不当选。

受县级以上人民政府及有关部门委托进行河湖生态补水的，免征水资源税，选项A不当选。水工程管理单位为配置或者调度水资源取水的，不征收水资源税，选项B当选。为发挥水资源税调控作用，按不同取用水性质实行差别税额，对取用地下水以及对特种行业取用水，均从高确定税额，洗浴中心属于特种行业，选项C当选。对增值税小规模纳税人、小型微利企业和个体工商户减半征收资源税（不含水资源税），选项D不当选。