金条交易双方均在中国境内，不涉及货物进出口，无须缴纳关税，选项A不当选；金条与金银首饰不同，金条不属于消费税征税范围，无须缴纳消费税，选项B、C不当选；纳税人销售货物，需要缴纳增值税，选项D当选。

本题考查购进农产品进项税额抵扣的计算。解题思路两步法：第一步确定计算准予抵扣进项税额的基数；第二步确定适用的扣除率（本题已知适用9%的扣除率）。“何处购进”是确定基数的突破口，本题是从按简易计税方法依3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人处购进，因此以增值税专用发票上注明的金额作为计算抵扣进项税额的基数。甲公司当月购进农产品准予抵扣的进项税额=10000×9%＝900（元）。

（1）委托加工应税消费品的，按照受托方同类消费品的销售价格计算纳税；没有同类消费品销售价格的，按照组成计税价格计算纳税，本题烟丝无受托方同类售价，因此组价；（2）烟丝从价计征消费税，其组成计税价格＝（材料成本＋加工费）÷（1－比例税率），加工费为不含增值税税款，排除选项B、D；（3）甲厂应代收代缴的消费税税额＝组成计税价格×比例税率=（140000＋21000）÷（1－30%）×30%=69000（元）。