本题考查其他税收制度的计税依据。

城镇土地使用税的计税依据是实际占用的土地面积，所以是从量计征税额的。选项A、B、C属于从价计征，错误。

本题考查印花税。

应税合同的计税依据，为合同所列的金额，不包括列明的增值税税额。印花税应纳税额的计算公式为：应纳税额=计税依据×适用税率。已知财产租赁合同的印花税税率为1‰。

依据题干数据，甲公司应纳印花税=50 000×3×1‰＝150（元）。

因此，本题正确答案为选项B。

本题考查城市维护建设税。

城建税实行地区差别比例税率，按照纳税人所在地的不同，税率分别为7%、5%、1%三个档次。具体是：纳税人所在地在市区，税率为7%；纳税人所在地在县城、镇的，税率为5%；纳税人所在地不在市区、县城或镇的，税率为1%。

因此，本题正确答案为选项C。

本题考查印花税。

无息或者贴息借款合同、国际金融组织向中国提供优惠贷款书立的借款合同免征印花税，其他两项需要缴纳印花税，同一应税凭证由两方以上当事人书立的，按照各自涉及的金额分别计算应纳税额。印花税应纳税额的计算公式为：应纳税额=计税依据×适用税率。

依据题干数据，该企业应纳印花税=100 000×3×1‰+200 000×0.3‰=360（元）。
因此，本题正确答案为选项D。