在评价函证的可靠性时，注册会计师应当考虑：（1）对询证函的设计、发出及收回的控制情况（选项A）；（2）被询证者的胜任能力、独立性、授权回函情况、对函证项目的了解及其客观性（选项C）；（3）被审计单位施加的限制或回函中的限制（选项D）。

选项B，审计证据的充分性是对审计证据数量的衡量，主要与注册会计师确定的样本量有关，审计证据的适当性是对审计证据质量的衡量，不当选；选项C，函证、重新计算均是实质性程序中所运用的具体审计程序，分析程序一般用于风险评估程序和实质性程序，一般不可以用于获取与内部控制相关的审计证据，不当选；选项D，在某些情况下，存货监盘是证实存货存在性认定的重要审计程序，注册会计师在审计中不得以检查成本高或难以实施为由而不执行该程序，不当选。