职业判断运用环节和情形从决定是否接受业务委托，到出具业务报告的各类决策，选项D当选。职业判断对于作出下列决策尤为重要：（1）确定重要性，识别和评估重大错报风险，选项A当选;（2）为满足审计准则的要求和收集审计证据的需要，确定所需实施的审计程序的性质、时间安排和范围；（3）为实现审计准则规定的目标和注册会计师的总体目标，评价是否已获取充分、适当的审计证据以及是否还需执行更多的工作；（4）评价管理层在运用适用的财务报告编制基础时作出的判断；（5）根据已获取的审计证据得出结论，如评价管理层在编制财务报表时作出的会计估计的合理性，选项B当选；（6）运用职业道德概念框架识别、评估和应对影响职业道德基本原则的不利因素，选项C当选。

审计的固有限制源于:（1）财务报告的性质（选项B当选）；（2）审计程序的性质（选项A、C当选）；（3）在合理的时间内以合理的成本完成审计的需要（选项D当选）。