财务报表审计工作的总体目标：（1）对财务报表整体是否不存在舞弊或错误导致的重大错报获取合理保证，使注册会计师能够对财务报表是否在所有重大方面按照适用的财务报告编制基础编制发表审计意见，选项A当选；（2）按照审计准则的规定，根据审计结果对财务报表出具审计报告，并与管理层和治理层沟通，选项D当选。

职业判断涉及注册会计师执业中的各类决策，包括与具体会计处理相关的决策、与审计程序相关的决策，以及与遵守职业道德要求相关的决策，选项D当选。