利息来源国对利息也有征税的权利，但对征税权的行使进行了限制，即设定了最高税率，且限制税率与受益所有人自身性质有关，受益所有人为银行或金融机构的情况下，利息的征税税率为7%。

选项A，审计合同不属于印花税的征税范围；选项B，应按照产权转移书据缴纳印花税；选项C，军事物资运输凭证免征印花税；选项D，农业保险合同免税。

个体工商户业主本人缴纳的补充养老保险费、补充医疗保险费，以当地（地级市）上年度社会平均工资的3倍为计算基数，分别在不超过该计算基数5%标准内的部分据实扣除；超过部分，不得扣除。

选项A、B、D、E，环境保护、节能节水项目的所得，自项目取得第一笔生产经营收入所属纳税年度起，第1年至第3年免征企业所得税，第4年至第6年减半征收企业所得税。符合条件的环境保护、节能节水项目包括：公共污水处理、公共垃圾处理、沼气综合开发利用、节能减排技术改造、海水淡化等。

选项C，国家鼓励的软件企业，自盈利年度起，享受两免三减半政策。