抵押权与质权属于意定担保物权，选项A、B不当选。留置权属于法定担保物权，选项C当选。用益物权与担保物权是并列关系，用益物权不属于担保物权，选项D不当选。

公积金弥补公司亏损，应当先使用任意公积金和法定公积金；仍不能弥补的，可以按照规定使用资本公积金。公司依照前述规定弥补亏损后，仍有亏损的，可以减少注册资本弥补亏损。本题中，该公司可先用盈余公积100万元弥补亏损，其次使用10万元的资本公积金弥补亏损，最后通过减少注册资本10万元弥补亏损，选项A当选。

对证券登记结算机构承担清算交收责任的是作为结算参与人的证券公司，选项C当选。

《反垄断法》的适用除外包括：（1）知识产权的正当行使，选项C不当选。（2）农业生产中的联合或者协同行为，选项D当选。对于铁路、石油、电信、电网、烟草等重点行业，国家通过立法赋予国有企业以垄断性经营权，但是，如果这些国有垄断企业从事垄断协议、滥用市场支配地位行为，或者从事可能排除、限制竞争的经营者集中行为，同样应受《反垄断法》的规制，选项A不当选。期刊出版行业不属于《反垄断法》适用除外的行业，选项B不当选。