选项A，企业之间支付的管理费不得税前扣除；选项C，除委托个人代理外，企业以现金等非转账方式支付的手续费及佣金不得在税前扣除；选项D，企业通过公益性社会团体或者县级（含县级）以上人民政府及其组成部门和直属机构，用于符合规定的公益事业的捐赠，准予在限额内税前扣除，直接向灾民发放的慰问金不得税前扣除。

医药制造企业发生的广告费支出和业务宣传费支出，不超过当年销售（营业）收入30%的部分，准予扣除；超过部分，准予在以后纳税年度结转扣除，选项A不当选。软件生产企业发生的职工教育经费中的职工培训费用，可以按实际发生额在企业所得税税前扣除，选项B当选。非金融企业向非金融企业借款的利息支出，不超过按照金融企业同期同类贷款利率计算的数额的部分可据实扣除，超过部分不许扣除，选项C不当选。从事代理服务、主营业务收入为手续费、佣金的企业（如证券、期货、保险代理等企业），其为取得该类收入而实际发生的营业成本（包括手续费及佣金支出），准予在企业所得税税前据实扣除，选项D当选。