一般来说，借款企业可以用三种方法支付银行贷款利息，包括收款法，贴现法，加息法。补偿性余额是企业借款的信用条件，不是利息支付方式。加息法要求企业在贷款期内分期偿还本息之和的金额，由于贷款分期均衡偿还，借款企业实际上只平均使用了贷款本金的半数，却支付全额利息。这样，企业所负担的有效年利率便高于报价利率大约1倍。因此选项A正确。

因为借款金额=申请贷款的数额×（1-补偿性余额比率），所以本题中需要向银行申请的贷款数额=250/（1-5%）=263.16（万元），所以选项D正确。

该笔借款的资本成本=1000×6%×（1-25%）/[1000×（1-15%）]=5.3%，选项A正确。

周转信用协议是金融机构与企业签订的一种正式的最高限额的借款协议，借款企业必须按借款限额未使用部分的一定比例向金融机构支付承诺费；对企业来说，补偿余额提高了借款的实际利率。因此选项A正确。