银行存款日记账应按企业在银行开立的账户和币种分别设置，选项C正确；由出纳人员根据与银行存款收付业务有关的记账凭证，按时间先后顺序逐日逐笔进行登记，选项A错误；根据银行存款收款凭证和有关的库存现金付款凭证（如现金存入银行的业务）登记银行存款收入栏，根据银行存款付款凭证登记其支出栏，选项B错误；银行存款日记账可以采用三栏式和多栏式，选项D错误。