作者将自己的文字作品手稿原件或复印件公开拍卖取得的所得，按照“特许权使用费所得”项目缴纳个人所得税，选项A不当选。应邀担任学术会议主讲嘉宾取得的报酬，属于个人独立从事非雇佣的各种劳务取得的所得，按照“劳务报酬所得”缴纳个人所得税，选项B不当选。李某将研究成果整理成文章发表取得的报酬和将自己的摄影作品发表在书画杂志取得的报酬，应按“稿酬所得”缴纳个人所得税，因此，选项C、D正确。

选项A，工资、薪金所得适用七级超额累进税率；选项C，财产转让所得适用比例税率；选项BD，个体工商户生产经营所得和个人承包承租经营所得均属于“经营所得”，适用五级超额累进税率。