选项 A，农民、家庭农场、农民专业合作社、农村集体经济组织、村民委员会购买农业生产资料或者销售农产品书立的买卖合同和农业保险合同，免征印花税；选项 B，无息或者贴息借款合同、国际金融组织向中国提供优惠贷款书立的借款合同，免征印花税；选项 D，非营利性医疗卫生机构采购药品或者卫生材料书立的买卖合同，免征印花税。

城镇土地使用税是国家在城市、县城、建制镇和工矿区范围内，对使用土地的单位和个人，以其实际占用的土地面积为计税依据，按照规定的税额计算征收的一种税。征税范围不包括农村土地（选项 C）。

选项 A、B、C，属于纳税人应当进行土地增值税清算的情形，抓住关键字：“转让土地使用权”“整体转让”和“全部”；选项 D，对于取得房地产销售（预售）许可证满 3 年尚未销售完毕的，主管税务机关可要求纳税人进行土地增值税清算。

环境保护税按月计算，按季申报缴纳；不能按固定期限计算缴纳的，可以按次申报缴纳。