甲公司在该项合同中收取的管理费和业绩奖励的金额都受到股票价格波动的影响（影响基金净值），均为可变对价，选项D错误；由于管理费收入是每季度末按该基金净值的2%收取的，且该管理费不会因基金净值的后续变化而调整或被要求退回，即影响该季度管理费收入金额的不确定性已经消除，则甲公司2024年12月31日应确认管理费收入＝160000×2%＝3200（万元），选项A错误、选项C正确；由于第二项报酬的条件是：该基金若是在两年内累计回报超过20%，则超额回报部分的25%将作为业绩奖励给予甲公司，即业绩奖励收入仍然会受到基金未来累计回报的影响，有关将可变对价计入交易价格的限制条件仍然没有得到满足，则甲公司2024年不应确认业绩奖励的收入，选项B错误。

合同开始日后，非现金对价的公允价值因对价形式而发生变动的，该变动金额不应计入交易价格，选项C不当选。

代理人通常应按照预期有权收取的佣金或手续费的金额确认收入，该金额应当按照已收或应收对价总额扣除应支付给其他相关方的价款后的净额，或者按照既定的佣金金额或比例等确定，选项D当选。