可以抵扣的增值税进项税额不计入原材料的初始入账金额，故该批原材料的初始入账金额=100+1=101（万元），选项D当选。

存货的采购成本，包括购买价款（选项A）、相关税费（选项B）、运输费、装卸费、保险费以及其他可归属于存货采购成本的费用（选项C）。选项D，应计入应交税费——应交增值税（进项税额）。

外购原材料的成本包括购买价款、相关税费、运输费、装卸费、保险费以及其他可归属于存货成本的其他费用（包括仓储费、包装费、运输途中的合理损耗、入库前的挑选整理费用等），不包括入库后的仓储费用，选项ABC当选。

企业采用先进先出法核算发出商品的成本，先购进的商品先发出。

结存材料实际成本=月初材料实际成本+本月购入材料实际成本-本月发出材料实际成本。月初M材料实际成本=300×10=3 000（万元），本月购入M材料实际成本=200×11（第一批购入）+100×12（第二批购入）=3 400（万元），本月发出M材料400吨的实际成本=300×10（月初材料单位成本）+100×11（5日购入的单位成本）=4 100（万元）。故该企业9月末结存M材料的实际成本=3 000+3 400-4 100=2 300（万元）。