甲公司财务会计制度能够如实核算和提供生产经营情况，并能正确计算应纳税款和如实履行纳税义务，适用查账征收（选项 B）。

选项 A，适用于税务机关批准的生产、经营规模小，达不到建账标准，难以查账征收，不能准确计算计税依据的个体工商户和个人独资企业；

选项 C，适用于生产经营规模较小、产品零星、税源分散、会计账册不健全，但能控制原材料或进销货的小型厂矿和作坊；

选项 D，适用于纳税人财务制度不健全、生产经营不固定、零星分散、流动性大的税源。

纳税人因有特殊困难不能按期缴纳税款的，经批准可以延期缴纳税款，但最长不得超过 3 个月。

发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的，由税务机关核定其应纳税额。

选项 D，纳税人未按照规定的期限“缴纳税款”，经税务机关责令限期缴纳，逾期仍不缴纳的，税务机关可以采取强制执行措施，而非核定其应纳税额。若改为纳税人发生纳税义务，未按照规定的期限办理“纳税申报”，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的，则税务机关有权核定应纳税额。