甲公司应编制如下会计分录：

借：在建工程                         200

       应交税费——应交增值税（进项税额）26

       贷：实收资本                         180

              资本公积——资本溢价              46

企业回购股票但未注销时，借记“库存股"科目，贷记"银行存款"等科目，不涉及“股本”科目，即不会影响股本总额。因此，本题表述错误。

未分配利润=可供分配利润-提取法定盈余公积-提取任意盈余公积-向投资者分配利润；可供分配利润=当年实现的净利润（或净亏损）+年初未分配利润（或-年初未弥补亏损）+其他转入（如盈余公积补亏）。

2022年12月31日，该企业未分配利润余额=300+200-20-90=390(万元）。故选A正确。