企业发生的非正常损失，如因管理不善造成货物被盗、丢失、霉烂变质，以及因违反法律法规被执法部门依法没收或强令自行销毁的货物损失等情形，其进项税额需要转出，不得从销项税额中抵扣。故，本题说法正确。

小规模纳税人采用简易计税方法，进项税额不得抵扣，就算取得了增值税专用发票，进项税额也不得抵扣。即购进货物、应税服务或应税行为，取得增值税专用发票上注明的增值税，一律不予抵扣，直接计入相关成本费用或资产。

选项 A 错误，计入委托加工物资的成本；选项 B 正确，应借记“税金及附加”科目，贷记“应交税费——应交消费税”科目；选项 C 错误，应借记“在建工程”科目，贷记“应交税费——应交消费税”科目；选项 D 错误，应借记“应交税费——应交消费税”科目，贷记“银行存款”等科目。

企业转让的土地使用权连同地上建筑物及其附着物一并在“固定资产”科目核算的，转让时应交的土地增值税，借记“固定资产清理”科目，贷记“应交税费——应交土地增值税”科目。