认定层次的重大错报风险包括固有风险和控制风险，选项A当选；重大错报风险只能评估和识别，其不能被注册会计师降低、消除，选项B当选；审计准则规定，对于识别岀的认定层次重大错报风险，注册会计师应当分别评估固有风险和控制风险，对于识别出的财务报表层次重大错报风险，审计准则未明确规定，是应当分别评估固有风险和控制风险，还是合并评估，选项C当选。

审计的固有限制源于:（1）财务报告的性质（选项B当选）；（2）审计程序的性质（选项A、C当选）；（3）在合理的时间内以合理的成本完成审计的需要（选项D当选）。