纳税人从小规模纳税人商贸企业购进的农产品取得征收率为3%的专票，可按9%或者10%的扣除率计算抵扣。此种规定是为了保证纳税人的税负率，不承担过多的税收负担。农产品的来源渠道一般较难取得发票，一般纳税人对外销售按照13%的税率，如无法计算抵扣，税收压力会特别大。

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二、纳税人购进农产品，按下列规定抵扣进项税额：

（一）纳税人购进农产品，取得一般纳税人开具的增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书的，以增值税专用发票或海关进口增值税专用缴款书上注明的增值税额为进项税额；从按照简易计税方法依照3%征收率计算缴纳增值税的小规模纳税人取得增值税专用发票的，以增值税专用发票上注明的金额和11%的扣除率计算进项税额；取得（开具）农产品销售发票或收购发票的，以农产品销售发票或收购发票上注明的农产品买价和11%的扣除率计算进项税额。

财税〔2018〕32号《关于调整增值税税率的通知》

二、纳税人购进农产品，原适用11%扣除率的，扣除率调整为10%。

财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号《关于深化增值税改革有关政策的公告》

二、纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。

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