本题考查增值税应纳税额的计算。

纳税人销售额超过小规模纳税人标准，应当办理一般纳税人资格登记而未办理的，应按销售额和增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，也不得使用增值税专用发票。餐饮服务属于生产生活服务，适用增值税税率6%。

依据题干数据，该纳税人应缴纳的增值税＝109.18÷（1＋6%）×6%＝6.18（万元）。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查船舶吨税。

【选项E错误】非机动驳船按相同净吨位船舶税率的50%计征税款。

因此，本题正确答案为选项ABCD。

本题考查政府预算模式。

【选项AB正确】政府预算模式按政府预算编制的结构划分：单式预算和复式预算。

【选项CD错误】政府预算模式按政府预算编制的方法划分：基数预算和零基预算。

【选项E错误】政府预算模式按政府预算编制的时间跨度划分：年度预算和多年预算。

因此，本题正确答案为选项AB。

本题考查增值税应纳税额的计算。

纳税人为销售货物而出租出借包装物收取的押金，单独记账核算的，不并入销售额征税。但是，对因逾期未收回包装物不再退还的押金，以及超过1年（含1年）以上仍不退还的押金（无论包装物周转使用期限长短），均并入销售额，按照所包装货物的适用税率计算增值税。

依据题干数据，该企业当月应缴纳增值税=〔200+3÷（1+13%）〕×13%=26.35（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。