纳税人提供国内交通运输服务，适用税率为9%；纳税人提供货物保管、装卸搬运服务，属于物流辅助服务，适用税率为6%；国际运输服务适用零税率。

选项A，货物保管收入的销项税额＝55.12÷（1＋6%）×6%＝3.12（万元）。

选项B，装卸搬运收入的销项税额＝93.28÷（1＋6%）×6%＝5.28（万元）。

选项C，国内运输收入的销项税额＝1035.5÷（1＋9%）×9%＝85.5（万元）。

选项D，国际运输收入的销项税额＝0（万元）。

（1）扣缴义务人应扣缴增值税税额＝购买方支付的价款÷（1＋税率）×税率＝500÷（1＋6%）×6%＝28.3（万元）。

（2）税率的适用和国内相关服务、无形资产、不动产税率相同，不区分小规模纳税人和一般纳税人。

选项B，一般纳税人取得的长期资产，是指以直接购买，自行生产、研发或者建造，接受投资、捐赠或者抵债等各种方式取得的长期资产；不包括租入的长期资产，在施工现场修建的临时建筑物、构筑物，以及房地产开发企业自行开发按照存货核算的房地产项目。

选项E，纳税人因实施符合条件的资产重组被合并，办理注销税务登记的，注销登记前尚未抵扣的进项税额，可以由合并后的纳税人继续抵扣。