本题考查增值税应纳税额的计算。

水路运输的程租、期租业务，属于交通运输服务中的水路运输服务，税率为9%；打捞属于现代服务，税率为6%。

依据题干数据，该公司6月应缴纳的增值税=1 090÷（1+9%）×9%+272.5÷（1+9%）×9%+173.31÷（1+6%）×6%-39=83.31（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查账务调整的基本方法。

红字冲销法适用于会计科目用错，以及会计科目正确但核算金额错误的情况。一般情况下，在及时发现错误、没有影响后续核算的情况下多使用红字冲销法。

题干中账务处理属于会计科目运用正确，但金额错误，多记18 000元。应做的账务调整如下：

借：原材料            18 000

       贷：生产成本         18 000

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查印花税。

【选项D正确】发电厂与电网之间、电网与电网之间书立的购售电合同，应当按买卖合同税目缴纳印花税。

【选项E正确】企业之间书立的确定买卖关系、明确买卖双方权利义务的订单、要货单等单据，且未另外书立买卖合同的，应当按规定缴纳印花税。

【选项A、B、C错误】下列情形的凭证，不属于印花税征收范围：

（1）人民法院的生效法律文书，仲裁机构的仲裁文书，监察机关的监察文书。

（2）县级以上人民政府及其所属部门按照行政管理权限征收、收回或者补偿安置房地产书立的合同、协议或者行政类文书。

（3）总公司与分公司、分公司与分公司之间书立的作为执行计划使用的凭证。

因此，本题正确答案为选项DE。

本题考查政府预算编制。

【选项C错误】明确经国务院批准的省级地方政府举债，应限于预算中必需的建设投资的部分资金，举借的债务只能用于公益性资本支出（即用于公益性事业发展且能够形成资本的支出），不得用于经常性支出。

因此，本题正确答案为选项C。