个人股东股权转让所得个人所得税以发生股权变更企业所在地税务机关为主管税务机关。选项C当选。
居民企业纳税人具有下列情形之一的，核定征收企业所得税：
（1）依法可以不设置账簿的；
（2）依法应当设置但未设置账簿的；
（3）擅自销毁账簿或者拒不提供纳税资料的；
（4）虽设置账簿，但账目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全，难以查账的；
（5）发生纳税义务，未按照规定的期限办理纳税申报，经税务机关责令限期申报，逾期仍不申报的；
（6）申报的计税依据明显偏低，又无正当理由的。
某新建农产品批发企业2023年发生下列业务：
（1）3月份受让一宗土地，土地出让合同记载土地出让金15000万元、拆迁补偿费3000万元、市政建设配套费2000万元。该宗土地面积20万平方米，其中18万平方米用于农产品批发用房建设、2万平方米用于办公用房建设，当月办理了土地使用权证；
（2）3月份与某建筑企业签订批发市场建设项目总承包合同，记载金额40000万元；该项目9月份竣工备案；
（3）9月底将农产品批发用房转入“固定资产”账户，原值56160万元；办公用房转入“固定资产”账户，原值8320万元；
（4）9月签订农产品批发用房租赁合同，记载自10月1日起交付使用，租期1年，一次性收取1年租金4000万元。
（注：该项目所在地契税税率为4%，城镇土地使用税税率为8元/平方米，计算房产税余值减除比例30%）
居民个人李某在甲公司任职，同时担任甲公司监事，2023年度取得的相关收入情况如下：
（1）工资收入18000元/月，每月自行负担“三险一金”2000元。
（2）3月甲公司以80万元的价格向其出售一套90平方米的住房，甲公司购置该住房时的价格为130万元。
（3）因持有乙上市公司的限售股，4月取得股息收入20000元，5月限售股解禁。上年通过深港通购买了境内某公司在香港联交所上市的H股股票，本年6月，该公司向李某分配上年度H股股息3260元。
（4）6月李某为丙公司做了一场人才培养方面的培训，取得丙公司支付的报酬20000元，丙公司已按规定预扣预缴其税款3200元。
（5）7月取得甲公司支付的监事费80000元。
（6）8月取得专业技术人员职业资格继续教育证书一份。
（7）李某父亲名下有一套房产出租给个人居住，按市场价每月收取租金5200元。9月，李某父亲突发疾病身故，9月至当年年底的租金由李某负责收取支配，该房产未办理产权继承手续。
（其他相关资料：李某的双胞胎女儿均在上小学，经与妻子约定子女教育支出由李某按100%扣除；李某为独生子且其父母均为70岁；甲公司除向李某低价出售住房外当年共扣缴李某个人所得税15160元，不考虑出租住房的其他税费）。
选项A、B，3岁以下婴幼儿照护、子女教育、继续教育、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人支出，可以选择在预扣预缴时扣除，也可以选择在汇算清缴时扣除；选项C，李某有双胞胎女儿，子女教育支出按照每个子女“每月”2000元的标准定额扣除，当年可以扣除48000元。
应纳税所得额＝18000×12＋80000＋20000×（1－20%）－60000－2000×12－3000×12－3600－4000×12＝140400（元），应补缴个人所得税＝140400×10%－2520－3200－15160＝-6840（元）。李某2023年度综合所得汇算清缴时，应补缴个人所得税为0元，可以申请退税。
