纳税人提供国内交通运输服务，适用税率为9%；纳税人提供货物保管、装卸搬运服务，属于物流辅助服务，适用税率为6%；国际运输服务适用零税率。

选项A，货物保管收入的销项税额＝55.12÷（1＋6%）×6%＝3.12（万元）。

选项B，装卸搬运收入的销项税额＝93.28÷（1＋6%）×6%＝5.28（万元）。

选项C，国内运输收入的销项税额＝1035.5÷（1＋9%）×9%＝85.5（万元）。

选项D，国际运输收入的销项税额＝0。

选项A、B、E当选：均属于纳税人发生应税交易取得的与之相关的价款，应并入销售额中计算增值税销项税额。

选项C不当选：纳税人为销售货物（不包括啤酒、黄酒以外的其他酒类产品）而出租出借包装物收取的押金，单独记账的、时间在1年内又未过期的，不并入销售额征税；但对逾期未收回不再退还的包装物押金，应按所包装货物的适用税率计算纳税。

选项D不当选：4S店销售汽车同时向购买方收取的代购买方缴纳的车辆购置税、保险费，属于代为收取并转付给第三方的款项，不应并入销售额计算增值税销项税额。

选项A、D，购进货物用于简易计税、免税、集体福利、个人消费（含交际应酬消费），进项税额不可以抵扣。

选项B，购进货物用于对外投资属于增值税应税交易，进项税额可以抵扣。

选项C，发生正常损失，进项税额可以抵扣；发生非正常损失，进项税额不可以抵扣。