选项B，土地使用权交换的，其契税的计税依据是所交换的土地使用权的价格差额。

选项C，出让国有土地使用权的，其契税计税价格为承受人为取得该土地使用权而支付的全部经济利益。

选项D，土地使用权赠与的，以征收机关参照土地使用权出售的市场价格核定的价格为计税依据。

（1）土地使用权交换、房屋交换，支付补价的一方纳税。

（2）房屋承受方缴纳契税，房产抵债，应由丙某缴纳契税，甲不缴纳契税。

（3）以自有房产作股投入本人独资经营的企业，免纳契税。

（4）综上所述，甲某应缴纳契税＝15×3%＝0.45（万元）。

选项D，承受国有土地使用权应支付的土地出让金，要征收契税，不得因减免出让金而减免契税。

选项E，计税依据为应补缴的土地收益金及应补缴政府的其他费用。

（1）以协议方式出让的，契税计税价格为成交价格。成交价格包括土地出让金、土地补偿费、安置补助费、地上附着物和青苗补偿费、拆迁补偿费、市政建设配套设施费等承受者应支付的货币、实物、无形资产及其他经济利益。

（2）该企业应缴纳的契税＝（3000＋1000＋500）×4%＝180（万元）。