选项A，公立学校占用耕地免征耕地占用税，但学校内经营性场所和教职工住房占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税。

选项B，公路线路占用耕地，可以减按每平方米2元的税额标准征收耕地占用税；但专用公路和城区内机动车道占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税。

选项C，军事设施占用耕地，免征耕地占用税。

选项D，免税的医疗机构（是指县级以上人民政府卫生健康行政部门批准设立的医疗机构）占用耕地免征耕地占用税，但医疗机构内职工住房占用耕地的，按照当地适用税额缴纳耕地占用税。

在人均耕地低于0.5亩的地区，省、自治区、直辖市可以根据当地经济发展情况，适当提高耕地占用税的适用税额，但提高的部分不得超过确定的适用税额的50%。

【知识点拓展】

耕地占用税应纳税额：

按实际占用耕地面积执行定额税率，一次性征收。
加征规定：

①在人均耕地低于 0.5 亩地区，加征不超过50%；

②占用基本农田的，加按 150% 。